AutoDock Vina

项目主页:http://vina.scripps.edu

开发者:Dr. Oleg Trott from The Scripps Research Institute

当前版本:1.1.2

License: 开源免费



概况

Autodock Vina,它是继Scripps实验室的Autodock 4对接程序之后由Oleg Trott等人推出的使用新的分子对接软件。
Vina是一个命令行程序,它可以通过GUI界面接口和Autodock Tools配合使用,也可以在Windows的命令提示符程序或Linux或是 Mac的终端中执行这个程序。

主要功能

Autodock Vina提高了结合模式预测的平均准确度,通过使用更简单的打分函数加快了搜索速度,并且在处理约20个可旋转键的体系时仍然能提供重现性较好的对接结果。它的使用方法和Autodock 4类似,只是少了调用AutoGrid程序(原 Autodock 4 中需要用到)这一步。



参考资料

  • http://vina.scripps.edu
  • https://baike.baidu.com/item/autodock/5684905?fr=aladdin


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